Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXB3P14651 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXB3P14651 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HOXB3P14651 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB3P14651 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB3P14651 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB3P14651 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB3P14651 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB3P14651 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB3P14651 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB3P14651 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB3P14651 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB3P14651 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HOXB3P14651 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HOXB3P14651 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB3P14651 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB3P14651 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB3P14651 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB3P14651 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB3P14651 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXB3P14651 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXB3P14651 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXB3P14651 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXB3P14651 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXB3P14651 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXB3P14651 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXB3P14651 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXB3P14651 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXB3P14651 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXB3P14651 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB3P14651 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXB3P14651 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXB3P14651 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXB3P14651 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB3P14651 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB3P14651 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXB3P14651 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXB3P14651 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB3P14651 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB3P14651 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXB3P14651 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXB3P14651 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms