Protein–RNA interactions for Protein: P13688

CEACAM1, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM1P13688 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEACAM1P13688 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CEACAM1P13688 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEACAM1P13688 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEACAM1P13688 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEACAM1P13688 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CEACAM1P13688 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEACAM1P13688 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEACAM1P13688 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CEACAM1P13688 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CEACAM1P13688 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEACAM1P13688 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEACAM1P13688 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEACAM1P13688 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CEACAM1P13688 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEACAM1P13688 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEACAM1P13688 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CEACAM1P13688 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEACAM1P13688 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEACAM1P13688 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEACAM1P13688 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEACAM1P13688 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CEACAM1P13688 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CEACAM1P13688 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CEACAM1P13688 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CEACAM1P13688 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CEACAM1P13688 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CEACAM1P13688 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEACAM1P13688 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEACAM1P13688 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CEACAM1P13688 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEACAM1P13688 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CEACAM1P13688 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEACAM1P13688 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms