Protein–RNA interactions for Protein: P13647

KRT5, Keratin, type II cytoskeletal 5, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT5P13647 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT5P13647 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KRT5P13647 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT5P13647 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
KRT5P13647 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT5P13647 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT5P13647 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
KRT5P13647 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT5P13647 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT5P13647 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
KRT5P13647 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT5P13647 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT5P13647 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT5P13647 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT5P13647 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KRT5P13647 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT5P13647 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT5P13647 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT5P13647 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KRT5P13647 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT5P13647 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT5P13647 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT5P13647 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KRT5P13647 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT5P13647 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT5P13647 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT5P13647 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT5P13647 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT5P13647 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT5P13647 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT5P13647 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KRT5P13647 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT5P13647 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KRT5P13647 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT5P13647 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
KRT5P13647 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT5P13647 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT5P13647 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT5P13647 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT5P13647 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KRT5P13647 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT5P13647 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT5P13647 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT5P13647 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT5P13647 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT5P13647 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT5P13647 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT5P13647 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KRT5P13647 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KRT5P13647 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KRT5P13647 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KRT5P13647 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT5P13647 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
KRT5P13647 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT5P13647 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
KRT5P13647 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT5P13647 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT5P13647 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KRT5P13647 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT5P13647 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT5P13647 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
KRT5P13647 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT5P13647 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT5P13647 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT5P13647 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT5P13647 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KRT5P13647 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT5P13647 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT5P13647 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT5P13647 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT5P13647 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT5P13647 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT5P13647 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT5P13647 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT5P13647 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT5P13647 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
KRT5P13647 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT5P13647 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT5P13647 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT5P13647 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT5P13647 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT5P13647 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT5P13647 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT5P13647 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT5P13647 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT5P13647 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT5P13647 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT5P13647 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT5P13647 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT5P13647 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT5P13647 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT5P13647 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT5P13647 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT5P13647 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT5P13647 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT5P13647 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT5P13647 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT5P13647 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
KRT5P13647 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT5P13647 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms