Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK4P11802 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK4P11802 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDK4P11802 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK4P11802 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK4P11802 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDK4P11802 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CDK4P11802 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK4P11802 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK4P11802 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK4P11802 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK4P11802 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK4P11802 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDK4P11802 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDK4P11802 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK4P11802 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDK4P11802 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK4P11802 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDK4P11802 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK4P11802 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK4P11802 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK4P11802 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK4P11802 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDK4P11802 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK4P11802 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDK4P11802 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK4P11802 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK4P11802 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK4P11802 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK4P11802 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK4P11802 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK4P11802 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK4P11802 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDK4P11802 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDK4P11802 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK4P11802 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CDK4P11802 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK4P11802 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDK4P11802 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK4P11802 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK4P11802 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK4P11802 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDK4P11802 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK4P11802 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK4P11802 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK4P11802 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK4P11802 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDK4P11802 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK4P11802 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK4P11802 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK4P11802 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDK4P11802 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDK4P11802 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK4P11802 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK4P11802 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK4P11802 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK4P11802 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK4P11802 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK4P11802 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK4P11802 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK4P11802 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK4P11802 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK4P11802 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK4P11802 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK4P11802 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK4P11802 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK4P11802 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK4P11802 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK4P11802 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK4P11802 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK4P11802 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK4P11802 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK4P11802 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK4P11802 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK4P11802 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK4P11802 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK4P11802 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK4P11802 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK4P11802 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK4P11802 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK4P11802 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK4P11802 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK4P11802 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK4P11802 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK4P11802 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK4P11802 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK4P11802 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK4P11802 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK4P11802 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK4P11802 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK4P11802 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDK4P11802 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK4P11802 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK4P11802 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDK4P11802 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK4P11802 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDK4P11802 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDK4P11802 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CDK4P11802 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDK4P11802 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms