Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SFTPCP11686 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SFTPCP11686 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SFTPCP11686 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SFTPCP11686 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SFTPCP11686 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFTPCP11686 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFTPCP11686 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFTPCP11686 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SFTPCP11686 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFTPCP11686 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFTPCP11686 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFTPCP11686 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFTPCP11686 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SFTPCP11686 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SFTPCP11686 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFTPCP11686 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFTPCP11686 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFTPCP11686 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SFTPCP11686 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SFTPCP11686 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFTPCP11686 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFTPCP11686 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFTPCP11686 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SFTPCP11686 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFTPCP11686 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SFTPCP11686 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFTPCP11686 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFTPCP11686 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFTPCP11686 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SFTPCP11686 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SFTPCP11686 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SFTPCP11686 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms