Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
LAMC1P11047 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
LAMC1P11047 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
LAMC1P11047 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
LAMC1P11047 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
LAMC1P11047 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
LAMC1P11047 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
LAMC1P11047 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
LAMC1P11047 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
LAMC1P11047 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
LAMC1P11047 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
LAMC1P11047 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
LAMC1P11047 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
LAMC1P11047 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
LAMC1P11047 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
LAMC1P11047 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
LAMC1P11047 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
LAMC1P11047 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
LAMC1P11047 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
LAMC1P11047 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
LAMC1P11047 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
LAMC1P11047 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
LAMC1P11047 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
LAMC1P11047 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
LAMC1P11047 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
LAMC1P11047 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
LAMC1P11047 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
LAMC1P11047 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
LAMC1P11047 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
LAMC1P11047 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
LAMC1P11047 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
LAMC1P11047 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
LAMC1P11047 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
LAMC1P11047 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
LAMC1P11047 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
LAMC1P11047 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
LAMC1P11047 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
LAMC1P11047 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
LAMC1P11047 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
LAMC1P11047 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
LAMC1P11047 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
LAMC1P11047 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
LAMC1P11047 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
LAMC1P11047 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
LAMC1P11047 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
LAMC1P11047 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
LAMC1P11047 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
LAMC1P11047 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
LAMC1P11047 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
LAMC1P11047 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
LAMC1P11047 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
LAMC1P11047 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
LAMC1P11047 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
LAMC1P11047 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
LAMC1P11047 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
LAMC1P11047 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
LAMC1P11047 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
LAMC1P11047 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
LAMC1P11047 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
LAMC1P11047 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
LAMC1P11047 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
LAMC1P11047 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
LAMC1P11047 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
LAMC1P11047 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
LAMC1P11047 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
LAMC1P11047 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
LAMC1P11047 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
LAMC1P11047 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
LAMC1P11047 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
LAMC1P11047 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
LAMC1P11047 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
LAMC1P11047 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
LAMC1P11047 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
LAMC1P11047 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
LAMC1P11047 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
LAMC1P11047 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
LAMC1P11047 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
LAMC1P11047 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
LAMC1P11047 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
LAMC1P11047 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
LAMC1P11047 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
LAMC1P11047 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
LAMC1P11047 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
LAMC1P11047 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
LAMC1P11047 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.27■■■■□ 3.4
LAMC1P11047 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
LAMC1P11047 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.4
LAMC1P11047 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
LAMC1P11047 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
LAMC1P11047 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
LAMC1P11047 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
LAMC1P11047 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
LAMC1P11047 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
LAMC1P11047 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
LAMC1P11047 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
LAMC1P11047 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
LAMC1P11047 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
LAMC1P11047 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
LAMC1P11047 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
LAMC1P11047 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms