Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLUP10909 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLUP10909 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLUP10909 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLUP10909 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLUP10909 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLUP10909 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLUP10909 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLUP10909 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLUP10909 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLUP10909 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLUP10909 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLUP10909 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLUP10909 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLUP10909 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLUP10909 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLUP10909 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLUP10909 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLUP10909 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLUP10909 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLUP10909 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLUP10909 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLUP10909 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLUP10909 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLUP10909 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLUP10909 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLUP10909 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLUP10909 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLUP10909 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLUP10909 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLUP10909 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLUP10909 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLUP10909 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLUP10909 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLUP10909 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLUP10909 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLUP10909 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLUP10909 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLUP10909 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLUP10909 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLUP10909 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLUP10909 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLUP10909 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLUP10909 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLUP10909 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLUP10909 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLUP10909 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLUP10909 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLUP10909 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLUP10909 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLUP10909 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLUP10909 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLUP10909 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLUP10909 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLUP10909 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLUP10909 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLUP10909 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLUP10909 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLUP10909 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLUP10909 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLUP10909 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLUP10909 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLUP10909 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLUP10909 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CLUP10909 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLUP10909 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLUP10909 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLUP10909 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLUP10909 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLUP10909 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLUP10909 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLUP10909 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLUP10909 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLUP10909 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLUP10909 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLUP10909 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLUP10909 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLUP10909 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLUP10909 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLUP10909 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLUP10909 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLUP10909 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLUP10909 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLUP10909 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLUP10909 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLUP10909 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLUP10909 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLUP10909 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLUP10909 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLUP10909 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLUP10909 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLUP10909 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLUP10909 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLUP10909 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLUP10909 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLUP10909 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLUP10909 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLUP10909 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLUP10909 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLUP10909 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms