Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GIMD1P0DJR0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GIMD1P0DJR0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GIMD1P0DJR0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GIMD1P0DJR0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GIMD1P0DJR0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GIMD1P0DJR0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GIMD1P0DJR0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GIMD1P0DJR0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GIMD1P0DJR0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GIMD1P0DJR0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GIMD1P0DJR0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GIMD1P0DJR0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GIMD1P0DJR0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GIMD1P0DJR0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GIMD1P0DJR0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GIMD1P0DJR0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GIMD1P0DJR0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GIMD1P0DJR0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GIMD1P0DJR0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GIMD1P0DJR0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GIMD1P0DJR0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GIMD1P0DJR0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GIMD1P0DJR0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GIMD1P0DJR0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GIMD1P0DJR0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GIMD1P0DJR0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GIMD1P0DJR0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GIMD1P0DJR0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GIMD1P0DJR0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GIMD1P0DJR0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GIMD1P0DJR0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GIMD1P0DJR0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GIMD1P0DJR0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GIMD1P0DJR0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GIMD1P0DJR0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GIMD1P0DJR0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GIMD1P0DJR0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GIMD1P0DJR0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GIMD1P0DJR0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GIMD1P0DJR0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GIMD1P0DJR0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GIMD1P0DJR0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GIMD1P0DJR0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GIMD1P0DJR0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GIMD1P0DJR0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GIMD1P0DJR0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GIMD1P0DJR0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GIMD1P0DJR0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GIMD1P0DJR0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GIMD1P0DJR0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
GIMD1P0DJR0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GIMD1P0DJR0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GIMD1P0DJR0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GIMD1P0DJR0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GIMD1P0DJR0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GIMD1P0DJR0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GIMD1P0DJR0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GIMD1P0DJR0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GIMD1P0DJR0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GIMD1P0DJR0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GIMD1P0DJR0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GIMD1P0DJR0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GIMD1P0DJR0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GIMD1P0DJR0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GIMD1P0DJR0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GIMD1P0DJR0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GIMD1P0DJR0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GIMD1P0DJR0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GIMD1P0DJR0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms