Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
RGPD1P0DJD0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
RGPD1P0DJD0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
RGPD1P0DJD0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RGPD1P0DJD0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RGPD1P0DJD0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
RGPD1P0DJD0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RGPD1P0DJD0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RGPD1P0DJD0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RGPD1P0DJD0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RGPD1P0DJD0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RGPD1P0DJD0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RGPD1P0DJD0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RGPD1P0DJD0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RGPD1P0DJD0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RGPD1P0DJD0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RGPD1P0DJD0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RGPD1P0DJD0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
RGPD1P0DJD0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RGPD1P0DJD0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
RGPD1P0DJD0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RGPD1P0DJD0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
RGPD1P0DJD0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RGPD1P0DJD0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RGPD1P0DJD0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RGPD1P0DJD0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RGPD1P0DJD0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
RGPD1P0DJD0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RGPD1P0DJD0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RGPD1P0DJD0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RGPD1P0DJD0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RGPD1P0DJD0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
RGPD1P0DJD0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RGPD1P0DJD0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
RGPD1P0DJD0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RGPD1P0DJD0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RGPD1P0DJD0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
RGPD1P0DJD0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RGPD1P0DJD0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RGPD1P0DJD0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RGPD1P0DJD0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
RGPD1P0DJD0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RGPD1P0DJD0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RGPD1P0DJD0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
RGPD1P0DJD0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RGPD1P0DJD0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RGPD1P0DJD0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RGPD1P0DJD0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RGPD1P0DJD0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RGPD1P0DJD0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RGPD1P0DJD0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RGPD1P0DJD0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
RGPD1P0DJD0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RGPD1P0DJD0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
RGPD1P0DJD0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
RGPD1P0DJD0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RGPD1P0DJD0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RGPD1P0DJD0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RGPD1P0DJD0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
RGPD1P0DJD0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RGPD1P0DJD0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RGPD1P0DJD0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RGPD1P0DJD0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
RGPD1P0DJD0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RGPD1P0DJD0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RGPD1P0DJD0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RGPD1P0DJD0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RGPD1P0DJD0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RGPD1P0DJD0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RGPD1P0DJD0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
RGPD1P0DJD0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RGPD1P0DJD0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RGPD1P0DJD0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RGPD1P0DJD0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RGPD1P0DJD0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RGPD1P0DJD0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RGPD1P0DJD0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
RGPD1P0DJD0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RGPD1P0DJD0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RGPD1P0DJD0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RGPD1P0DJD0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RGPD1P0DJD0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RGPD1P0DJD0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RGPD1P0DJD0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RGPD1P0DJD0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RGPD1P0DJD0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
RGPD1P0DJD0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RGPD1P0DJD0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RGPD1P0DJD0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
RGPD1P0DJD0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RGPD1P0DJD0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RGPD1P0DJD0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RGPD1P0DJD0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RGPD1P0DJD0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RGPD1P0DJD0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RGPD1P0DJD0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
RGPD1P0DJD0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
RGPD1P0DJD0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
RGPD1P0DJD0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
RGPD1P0DJD0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms