Protein–RNA interactions for Protein: P06315

IGKV5-2, Immunoglobulin kappa variable 5-2, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV5-2P06315 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
IGKV5-2P06315 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
IGKV5-2P06315 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
IGKV5-2P06315 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
IGKV5-2P06315 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
IGKV5-2P06315 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
IGKV5-2P06315 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
IGKV5-2P06315 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
IGKV5-2P06315 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
IGKV5-2P06315 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
IGKV5-2P06315 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
IGKV5-2P06315 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
IGKV5-2P06315 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
IGKV5-2P06315 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
IGKV5-2P06315 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
IGKV5-2P06315 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
IGKV5-2P06315 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
IGKV5-2P06315 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
IGKV5-2P06315 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
IGKV5-2P06315 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
IGKV5-2P06315 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
IGKV5-2P06315 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
IGKV5-2P06315 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
IGKV5-2P06315 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
IGKV5-2P06315 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
IGKV5-2P06315 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
IGKV5-2P06315 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
IGKV5-2P06315 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
IGKV5-2P06315 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
IGKV5-2P06315 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
IGKV5-2P06315 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
IGKV5-2P06315 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
IGKV5-2P06315 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
IGKV5-2P06315 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
IGKV5-2P06315 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
IGKV5-2P06315 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
IGKV5-2P06315 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
IGKV5-2P06315 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
IGKV5-2P06315 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
IGKV5-2P06315 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
IGKV5-2P06315 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
IGKV5-2P06315 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
IGKV5-2P06315 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
IGKV5-2P06315 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
IGKV5-2P06315 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
IGKV5-2P06315 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
IGKV5-2P06315 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
IGKV5-2P06315 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
IGKV5-2P06315 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
IGKV5-2P06315 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
IGKV5-2P06315 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
IGKV5-2P06315 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
IGKV5-2P06315 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
IGKV5-2P06315 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
IGKV5-2P06315 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
IGKV5-2P06315 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
IGKV5-2P06315 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
IGKV5-2P06315 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
IGKV5-2P06315 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
IGKV5-2P06315 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
IGKV5-2P06315 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
IGKV5-2P06315 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
IGKV5-2P06315 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
IGKV5-2P06315 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
IGKV5-2P06315 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
IGKV5-2P06315 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
IGKV5-2P06315 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
IGKV5-2P06315 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
IGKV5-2P06315 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
IGKV5-2P06315 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
IGKV5-2P06315 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
IGKV5-2P06315 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
IGKV5-2P06315 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
IGKV5-2P06315 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
IGKV5-2P06315 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
IGKV5-2P06315 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
IGKV5-2P06315 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
IGKV5-2P06315 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
IGKV5-2P06315 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
IGKV5-2P06315 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
IGKV5-2P06315 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
IGKV5-2P06315 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
IGKV5-2P06315 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
IGKV5-2P06315 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
IGKV5-2P06315 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
IGKV5-2P06315 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms