Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGB1P05556 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGB1P05556 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGB1P05556 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB1P05556 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGB1P05556 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB1P05556 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB1P05556 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGB1P05556 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ITGB1P05556 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGB1P05556 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGB1P05556 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ITGB1P05556 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB1P05556 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB1P05556 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ITGB1P05556 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGB1P05556 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ITGB1P05556 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGB1P05556 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGB1P05556 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGB1P05556 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ITGB1P05556 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ITGB1P05556 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGB1P05556 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
ITGB1P05556 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGB1P05556 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGB1P05556 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGB1P05556 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB1P05556 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB1P05556 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB1P05556 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB1P05556 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB1P05556 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB1P05556 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB1P05556 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGB1P05556 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB1P05556 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB1P05556 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB1P05556 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB1P05556 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB1P05556 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ITGB1P05556 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB1P05556 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB1P05556 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB1P05556 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ITGB1P05556 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ITGB1P05556 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB1P05556 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB1P05556 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB1P05556 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ITGB1P05556 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGB1P05556 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGB1P05556 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGB1P05556 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGB1P05556 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGB1P05556 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ITGB1P05556 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB1P05556 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB1P05556 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB1P05556 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ITGB1P05556 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ITGB1P05556 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB1P05556 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB1P05556 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB1P05556 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB1P05556 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB1P05556 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ITGB1P05556 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB1P05556 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB1P05556 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ITGB1P05556 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGB1P05556 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ITGB1P05556 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGB1P05556 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms