Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMG1P04279 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEMG1P04279 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMG1P04279 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMG1P04279 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMG1P04279 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEMG1P04279 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SEMG1P04279 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMG1P04279 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMG1P04279 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMG1P04279 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMG1P04279 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEMG1P04279 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMG1P04279 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEMG1P04279 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEMG1P04279 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMG1P04279 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMG1P04279 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMG1P04279 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMG1P04279 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMG1P04279 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMG1P04279 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMG1P04279 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMG1P04279 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEMG1P04279 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMG1P04279 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMG1P04279 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMG1P04279 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMG1P04279 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMG1P04279 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEMG1P04279 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMG1P04279 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMG1P04279 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMG1P04279 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMG1P04279 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMG1P04279 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMG1P04279 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMG1P04279 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMG1P04279 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMG1P04279 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMG1P04279 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMG1P04279 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMG1P04279 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMG1P04279 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMG1P04279 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMG1P04279 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMG1P04279 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMG1P04279 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMG1P04279 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMG1P04279 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMG1P04279 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMG1P04279 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMG1P04279 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMG1P04279 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMG1P04279 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMG1P04279 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMG1P04279 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMG1P04279 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 226 ms