Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOC1P02654 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOC1P02654 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOC1P02654 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APOC1P02654 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC1P02654 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC1P02654 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC1P02654 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC1P02654 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOC1P02654 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOC1P02654 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
APOC1P02654 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC1P02654 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC1P02654 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC1P02654 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOC1P02654 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC1P02654 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC1P02654 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC1P02654 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC1P02654 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC1P02654 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC1P02654 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC1P02654 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC1P02654 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC1P02654 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOC1P02654 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC1P02654 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC1P02654 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOC1P02654 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOC1P02654 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOC1P02654 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
APOC1P02654 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOC1P02654 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOC1P02654 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOC1P02654 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOC1P02654 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOC1P02654 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOC1P02654 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOC1P02654 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APOC1P02654 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APOC1P02654 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APOC1P02654 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
APOC1P02654 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOC1P02654 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOC1P02654 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APOC1P02654 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOC1P02654 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APOC1P02654 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOC1P02654 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOC1P02654 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APOC1P02654 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC1P02654 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC1P02654 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC1P02654 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC1P02654 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC1P02654 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC1P02654 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APOC1P02654 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC1P02654 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC1P02654 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC1P02654 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC1P02654 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC1P02654 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APOC1P02654 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC1P02654 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC1P02654 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APOC1P02654 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOC1P02654 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
APOC1P02654 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOC1P02654 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOC1P02654 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOC1P02654 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOC1P02654 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
APOC1P02654 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC1P02654 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC1P02654 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
APOC1P02654 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOC1P02654 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOC1P02654 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOC1P02654 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
APOC1P02654 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC1P02654 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC1P02654 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC1P02654 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC1P02654 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC1P02654 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC1P02654 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
APOC1P02654 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC1P02654 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC1P02654 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC1P02654 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
APOC1P02654 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC1P02654 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC1P02654 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC1P02654 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC1P02654 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC1P02654 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC1P02654 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC1P02654 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
APOC1P02654 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms