Protein–RNA interactions for Protein: P01579

IFNG, Interferon gamma, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNGP01579 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
IFNGP01579 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNGP01579 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNGP01579 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNGP01579 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNGP01579 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNGP01579 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IFNGP01579 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNGP01579 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IFNGP01579 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNGP01579 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IFNGP01579 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNGP01579 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IFNGP01579 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNGP01579 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFNGP01579 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNGP01579 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNGP01579 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNGP01579 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFNGP01579 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
IFNGP01579 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNGP01579 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNGP01579 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNGP01579 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNGP01579 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNGP01579 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNGP01579 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNGP01579 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFNGP01579 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNGP01579 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFNGP01579 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNGP01579 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNGP01579 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNGP01579 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNGP01579 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNGP01579 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNGP01579 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNGP01579 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFNGP01579 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNGP01579 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNGP01579 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNGP01579 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNGP01579 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNGP01579 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFNGP01579 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNGP01579 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNGP01579 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFNGP01579 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNGP01579 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNGP01579 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNGP01579 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNGP01579 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFNGP01579 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFNGP01579 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNGP01579 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNGP01579 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNGP01579 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFNGP01579 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNGP01579 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNGP01579 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNGP01579 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNGP01579 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNGP01579 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNGP01579 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFNGP01579 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNGP01579 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNGP01579 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNGP01579 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFNGP01579 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFNGP01579 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNGP01579 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNGP01579 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNGP01579 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNGP01579 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNGP01579 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNGP01579 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNGP01579 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFNGP01579 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNGP01579 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNGP01579 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNGP01579 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNGP01579 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNGP01579 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNGP01579 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IFNGP01579 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IFNGP01579 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNGP01579 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNGP01579 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IFNGP01579 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNGP01579 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNGP01579 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNGP01579 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNGP01579 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNGP01579 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNGP01579 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNGP01579 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IFNGP01579 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNGP01579 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNGP01579 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IFNGP01579 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms