Protein–RNA interactions for Protein: P01350

GAST, Gastrin, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GASTP01350 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GASTP01350 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GASTP01350 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GASTP01350 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GASTP01350 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GASTP01350 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GASTP01350 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GASTP01350 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GASTP01350 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GASTP01350 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GASTP01350 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GASTP01350 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GASTP01350 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GASTP01350 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GASTP01350 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GASTP01350 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GASTP01350 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GASTP01350 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GASTP01350 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GASTP01350 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GASTP01350 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GASTP01350 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GASTP01350 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GASTP01350 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GASTP01350 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GASTP01350 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GASTP01350 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GASTP01350 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GASTP01350 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GASTP01350 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GASTP01350 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GASTP01350 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GASTP01350 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GASTP01350 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GASTP01350 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GASTP01350 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GASTP01350 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GASTP01350 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GASTP01350 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GASTP01350 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GASTP01350 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GASTP01350 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GASTP01350 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GASTP01350 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GASTP01350 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GASTP01350 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GASTP01350 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GASTP01350 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GASTP01350 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GASTP01350 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GASTP01350 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GASTP01350 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GASTP01350 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GASTP01350 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GASTP01350 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GASTP01350 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GASTP01350 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GASTP01350 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GASTP01350 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GASTP01350 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GASTP01350 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GASTP01350 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GASTP01350 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GASTP01350 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GASTP01350 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GASTP01350 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GASTP01350 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GASTP01350 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GASTP01350 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GASTP01350 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GASTP01350 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GASTP01350 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GASTP01350 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GASTP01350 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GASTP01350 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GASTP01350 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GASTP01350 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GASTP01350 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GASTP01350 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GASTP01350 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GASTP01350 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GASTP01350 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GASTP01350 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GASTP01350 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GASTP01350 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GASTP01350 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GASTP01350 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GASTP01350 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GASTP01350 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GASTP01350 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GASTP01350 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GASTP01350 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GASTP01350 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GASTP01350 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GASTP01350 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GASTP01350 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
GASTP01350 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GASTP01350 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GASTP01350 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GASTP01350 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms