Protein–RNA interactions for Protein: P00734

F2, Prothrombin, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P00734 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
F2P00734 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
F2P00734 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
F2P00734 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
F2P00734 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
F2P00734 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
F2P00734 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
F2P00734 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
F2P00734 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
F2P00734 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
F2P00734 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
F2P00734 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
F2P00734 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
F2P00734 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
F2P00734 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
F2P00734 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
F2P00734 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
F2P00734 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
F2P00734 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
F2P00734 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
F2P00734 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
F2P00734 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
F2P00734 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
F2P00734 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
F2P00734 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
F2P00734 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
F2P00734 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
F2P00734 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
F2P00734 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
F2P00734 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
F2P00734 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
F2P00734 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
F2P00734 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
F2P00734 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
F2P00734 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
F2P00734 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
F2P00734 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
F2P00734 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
F2P00734 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
F2P00734 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
F2P00734 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
F2P00734 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
F2P00734 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
F2P00734 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
F2P00734 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
F2P00734 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
F2P00734 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
F2P00734 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
F2P00734 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
F2P00734 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
F2P00734 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
F2P00734 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
F2P00734 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
F2P00734 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
F2P00734 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
F2P00734 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
F2P00734 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
F2P00734 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
F2P00734 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
F2P00734 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
F2P00734 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
F2P00734 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
F2P00734 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
F2P00734 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
F2P00734 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
F2P00734 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
F2P00734 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
F2P00734 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
F2P00734 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
F2P00734 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
F2P00734 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
F2P00734 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
F2P00734 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
F2P00734 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
F2P00734 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
F2P00734 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
F2P00734 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
F2P00734 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
F2P00734 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
F2P00734 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
F2P00734 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
F2P00734 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
F2P00734 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
F2P00734 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
F2P00734 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
F2P00734 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
F2P00734 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
F2P00734 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
F2P00734 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
F2P00734 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
F2P00734 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
F2P00734 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
F2P00734 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
F2P00734 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
F2P00734 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
F2P00734 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
F2P00734 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
F2P00734 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
F2P00734 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
F2P00734 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms