Protein–RNA interactions for Protein: O95967

EFEMP2, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP2O95967 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFEMP2O95967 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFEMP2O95967 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
EFEMP2O95967 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFEMP2O95967 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFEMP2O95967 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFEMP2O95967 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
EFEMP2O95967 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFEMP2O95967 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
EFEMP2O95967 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
EFEMP2O95967 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
EFEMP2O95967 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFEMP2O95967 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
EFEMP2O95967 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFEMP2O95967 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFEMP2O95967 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
EFEMP2O95967 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
EFEMP2O95967 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
EFEMP2O95967 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EFEMP2O95967 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EFEMP2O95967 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
EFEMP2O95967 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EFEMP2O95967 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EFEMP2O95967 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EFEMP2O95967 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EFEMP2O95967 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EFEMP2O95967 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EFEMP2O95967 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EFEMP2O95967 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EFEMP2O95967 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EFEMP2O95967 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EFEMP2O95967 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EFEMP2O95967 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EFEMP2O95967 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EFEMP2O95967 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EFEMP2O95967 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EFEMP2O95967 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EFEMP2O95967 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EFEMP2O95967 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EFEMP2O95967 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
EFEMP2O95967 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EFEMP2O95967 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
EFEMP2O95967 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EFEMP2O95967 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EFEMP2O95967 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EFEMP2O95967 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EFEMP2O95967 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EFEMP2O95967 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EFEMP2O95967 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EFEMP2O95967 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EFEMP2O95967 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EFEMP2O95967 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EFEMP2O95967 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EFEMP2O95967 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EFEMP2O95967 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
EFEMP2O95967 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
EFEMP2O95967 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
EFEMP2O95967 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EFEMP2O95967 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EFEMP2O95967 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
EFEMP2O95967 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
EFEMP2O95967 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EFEMP2O95967 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
EFEMP2O95967 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
EFEMP2O95967 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EFEMP2O95967 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EFEMP2O95967 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
EFEMP2O95967 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
EFEMP2O95967 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EFEMP2O95967 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
EFEMP2O95967 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
EFEMP2O95967 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EFEMP2O95967 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EFEMP2O95967 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EFEMP2O95967 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
EFEMP2O95967 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EFEMP2O95967 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EFEMP2O95967 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EFEMP2O95967 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EFEMP2O95967 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EFEMP2O95967 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
EFEMP2O95967 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EFEMP2O95967 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EFEMP2O95967 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EFEMP2O95967 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EFEMP2O95967 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EFEMP2O95967 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EFEMP2O95967 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
EFEMP2O95967 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27■■□□□ 1.91
EFEMP2O95967 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EFEMP2O95967 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EFEMP2O95967 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EFEMP2O95967 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EFEMP2O95967 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EFEMP2O95967 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EFEMP2O95967 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EFEMP2O95967 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EFEMP2O95967 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EFEMP2O95967 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EFEMP2O95967 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms