Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA4FO95754 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA4FO95754 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEMA4FO95754 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA4FO95754 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SEMA4FO95754 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA4FO95754 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA4FO95754 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEMA4FO95754 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SEMA4FO95754 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA4FO95754 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA4FO95754 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SEMA4FO95754 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4FO95754 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4FO95754 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4FO95754 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4FO95754 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SEMA4FO95754 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA4FO95754 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SEMA4FO95754 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4FO95754 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4FO95754 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4FO95754 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA4FO95754 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA4FO95754 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA4FO95754 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA4FO95754 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA4FO95754 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA4FO95754 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4FO95754 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4FO95754 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4FO95754 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4FO95754 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4FO95754 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4FO95754 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4FO95754 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4FO95754 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4FO95754 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4FO95754 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4FO95754 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4FO95754 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA4FO95754 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA4FO95754 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4FO95754 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4FO95754 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA4FO95754 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA4FO95754 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA4FO95754 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA4FO95754 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4FO95754 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4FO95754 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4FO95754 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4FO95754 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4FO95754 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4FO95754 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4FO95754 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4FO95754 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA4FO95754 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA4FO95754 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA4FO95754 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA4FO95754 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA4FO95754 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA4FO95754 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA4FO95754 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA4FO95754 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA4FO95754 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA4FO95754 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA4FO95754 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA4FO95754 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA4FO95754 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA4FO95754 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms