Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX6O95503 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX6O95503 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBX6O95503 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBX6O95503 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBX6O95503 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBX6O95503 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBX6O95503 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CBX6O95503 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBX6O95503 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBX6O95503 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBX6O95503 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBX6O95503 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBX6O95503 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX6O95503 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX6O95503 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX6O95503 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX6O95503 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX6O95503 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBX6O95503 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBX6O95503 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBX6O95503 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBX6O95503 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBX6O95503 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBX6O95503 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBX6O95503 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX6O95503 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX6O95503 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX6O95503 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX6O95503 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBX6O95503 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBX6O95503 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBX6O95503 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBX6O95503 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBX6O95503 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX6O95503 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX6O95503 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CBX6O95503 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBX6O95503 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CBX6O95503 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBX6O95503 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CBX6O95503 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CBX6O95503 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CBX6O95503 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CBX6O95503 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CBX6O95503 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CBX6O95503 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CBX6O95503 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CBX6O95503 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CBX6O95503 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CBX6O95503 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CBX6O95503 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CBX6O95503 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX6O95503 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX6O95503 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX6O95503 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX6O95503 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX6O95503 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX6O95503 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX6O95503 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX6O95503 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBX6O95503 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBX6O95503 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBX6O95503 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBX6O95503 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBX6O95503 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBX6O95503 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CBX6O95503 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CBX6O95503 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CBX6O95503 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBX6O95503 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBX6O95503 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBX6O95503 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBX6O95503 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBX6O95503 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBX6O95503 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBX6O95503 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBX6O95503 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBX6O95503 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBX6O95503 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBX6O95503 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBX6O95503 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBX6O95503 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBX6O95503 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBX6O95503 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBX6O95503 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBX6O95503 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CBX6O95503 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBX6O95503 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBX6O95503 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBX6O95503 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBX6O95503 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBX6O95503 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBX6O95503 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBX6O95503 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBX6O95503 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBX6O95503 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBX6O95503 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBX6O95503 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CBX6O95503 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms