Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TRPM2O94759 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TRPM2O94759 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TRPM2O94759 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TRPM2O94759 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TRPM2O94759 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
TRPM2O94759 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TRPM2O94759 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
TRPM2O94759 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TRPM2O94759 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRPM2O94759 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRPM2O94759 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRPM2O94759 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRPM2O94759 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRPM2O94759 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRPM2O94759 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRPM2O94759 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRPM2O94759 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
TRPM2O94759 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRPM2O94759 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
TRPM2O94759 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
TRPM2O94759 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TRPM2O94759 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TRPM2O94759 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TRPM2O94759 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TRPM2O94759 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
TRPM2O94759 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TRPM2O94759 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TRPM2O94759 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
TRPM2O94759 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
TRPM2O94759 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TRPM2O94759 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TRPM2O94759 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TRPM2O94759 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TRPM2O94759 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TRPM2O94759 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TRPM2O94759 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TRPM2O94759 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
TRPM2O94759 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TRPM2O94759 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TRPM2O94759 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TRPM2O94759 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TRPM2O94759 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRPM2O94759 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TRPM2O94759 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TRPM2O94759 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
TRPM2O94759 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
TRPM2O94759 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TRPM2O94759 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TRPM2O94759 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
TRPM2O94759 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
TRPM2O94759 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
TRPM2O94759 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
TRPM2O94759 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
TRPM2O94759 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
TRPM2O94759 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TRPM2O94759 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TRPM2O94759 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TRPM2O94759 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
TRPM2O94759 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
TRPM2O94759 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
TRPM2O94759 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
TRPM2O94759 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
TRPM2O94759 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
TRPM2O94759 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
TRPM2O94759 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TRPM2O94759 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
TRPM2O94759 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TRPM2O94759 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
TRPM2O94759 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
TRPM2O94759 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TRPM2O94759 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
TRPM2O94759 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TRPM2O94759 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
TRPM2O94759 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
TRPM2O94759 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
TRPM2O94759 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.5
TRPM2O94759 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
TRPM2O94759 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
TRPM2O94759 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
TRPM2O94759 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRPM2O94759 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRPM2O94759 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRPM2O94759 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRPM2O94759 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
TRPM2O94759 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TRPM2O94759 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TRPM2O94759 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TRPM2O94759 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TRPM2O94759 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TRPM2O94759 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
TRPM2O94759 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
TRPM2O94759 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
TRPM2O94759 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
TRPM2O94759 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
TRPM2O94759 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TRPM2O94759 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
TRPM2O94759 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
TRPM2O94759 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
TRPM2O94759 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms