Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
FLOT1O75955 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FLOT1O75955 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FLOT1O75955 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FLOT1O75955 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FLOT1O75955 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FLOT1O75955 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
FLOT1O75955 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FLOT1O75955 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
FLOT1O75955 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FLOT1O75955 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FLOT1O75955 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FLOT1O75955 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
FLOT1O75955 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FLOT1O75955 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FLOT1O75955 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
FLOT1O75955 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
FLOT1O75955 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FLOT1O75955 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FLOT1O75955 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FLOT1O75955 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FLOT1O75955 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FLOT1O75955 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FLOT1O75955 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FLOT1O75955 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FLOT1O75955 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FLOT1O75955 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FLOT1O75955 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FLOT1O75955 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FLOT1O75955 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FLOT1O75955 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FLOT1O75955 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FLOT1O75955 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FLOT1O75955 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FLOT1O75955 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FLOT1O75955 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FLOT1O75955 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
FLOT1O75955 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FLOT1O75955 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FLOT1O75955 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FLOT1O75955 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FLOT1O75955 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FLOT1O75955 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FLOT1O75955 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
FLOT1O75955 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FLOT1O75955 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FLOT1O75955 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FLOT1O75955 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FLOT1O75955 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FLOT1O75955 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FLOT1O75955 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
FLOT1O75955 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
FLOT1O75955 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FLOT1O75955 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
FLOT1O75955 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FLOT1O75955 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FLOT1O75955 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FLOT1O75955 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FLOT1O75955 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FLOT1O75955 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FLOT1O75955 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FLOT1O75955 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FLOT1O75955 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FLOT1O75955 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FLOT1O75955 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FLOT1O75955 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FLOT1O75955 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FLOT1O75955 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
FLOT1O75955 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
FLOT1O75955 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FLOT1O75955 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FLOT1O75955 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FLOT1O75955 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
FLOT1O75955 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FLOT1O75955 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FLOT1O75955 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FLOT1O75955 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FLOT1O75955 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FLOT1O75955 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FLOT1O75955 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
FLOT1O75955 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FLOT1O75955 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FLOT1O75955 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FLOT1O75955 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FLOT1O75955 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FLOT1O75955 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FLOT1O75955 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FLOT1O75955 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FLOT1O75955 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FLOT1O75955 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FLOT1O75955 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FLOT1O75955 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FLOT1O75955 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FLOT1O75955 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
FLOT1O75955 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FLOT1O75955 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FLOT1O75955 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FLOT1O75955 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FLOT1O75955 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FLOT1O75955 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms