Protein–RNA interactions for Protein: O75365

PTP4A3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A3O75365 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A3O75365 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A3O75365 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A3O75365 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A3O75365 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A3O75365 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A3O75365 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTP4A3O75365 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTP4A3O75365 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTP4A3O75365 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTP4A3O75365 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTP4A3O75365 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTP4A3O75365 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTP4A3O75365 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTP4A3O75365 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTP4A3O75365 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTP4A3O75365 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTP4A3O75365 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTP4A3O75365 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTP4A3O75365 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTP4A3O75365 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTP4A3O75365 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTP4A3O75365 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTP4A3O75365 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTP4A3O75365 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTP4A3O75365 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTP4A3O75365 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTP4A3O75365 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTP4A3O75365 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTP4A3O75365 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTP4A3O75365 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTP4A3O75365 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTP4A3O75365 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTP4A3O75365 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTP4A3O75365 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTP4A3O75365 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTP4A3O75365 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTP4A3O75365 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A3O75365 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A3O75365 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A3O75365 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTP4A3O75365 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A3O75365 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A3O75365 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A3O75365 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A3O75365 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTP4A3O75365 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTP4A3O75365 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTP4A3O75365 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTP4A3O75365 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTP4A3O75365 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTP4A3O75365 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTP4A3O75365 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTP4A3O75365 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTP4A3O75365 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTP4A3O75365 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTP4A3O75365 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTP4A3O75365 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTP4A3O75365 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PTP4A3O75365 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PTP4A3O75365 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTP4A3O75365 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTP4A3O75365 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTP4A3O75365 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTP4A3O75365 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTP4A3O75365 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTP4A3O75365 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTP4A3O75365 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTP4A3O75365 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTP4A3O75365 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTP4A3O75365 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTP4A3O75365 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTP4A3O75365 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTP4A3O75365 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTP4A3O75365 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTP4A3O75365 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTP4A3O75365 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTP4A3O75365 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTP4A3O75365 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTP4A3O75365 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTP4A3O75365 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A3O75365 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A3O75365 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A3O75365 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A3O75365 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A3O75365 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A3O75365 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A3O75365 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTP4A3O75365 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTP4A3O75365 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTP4A3O75365 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTP4A3O75365 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTP4A3O75365 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTP4A3O75365 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTP4A3O75365 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTP4A3O75365 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTP4A3O75365 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTP4A3O75365 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTP4A3O75365 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTP4A3O75365 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms