Protein–RNA interactions for Protein: O60831

PRAF2, PRA1 family protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAF2O60831 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAF2O60831 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAF2O60831 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAF2O60831 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAF2O60831 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAF2O60831 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAF2O60831 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAF2O60831 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAF2O60831 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAF2O60831 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAF2O60831 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAF2O60831 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAF2O60831 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAF2O60831 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAF2O60831 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAF2O60831 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAF2O60831 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAF2O60831 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAF2O60831 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAF2O60831 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PRAF2O60831 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAF2O60831 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAF2O60831 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAF2O60831 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAF2O60831 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRAF2O60831 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAF2O60831 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAF2O60831 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAF2O60831 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAF2O60831 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAF2O60831 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAF2O60831 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAF2O60831 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAF2O60831 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAF2O60831 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAF2O60831 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAF2O60831 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAF2O60831 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAF2O60831 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAF2O60831 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRAF2O60831 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRAF2O60831 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRAF2O60831 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PRAF2O60831 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRAF2O60831 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAF2O60831 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAF2O60831 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAF2O60831 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAF2O60831 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRAF2O60831 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRAF2O60831 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRAF2O60831 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAF2O60831 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAF2O60831 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAF2O60831 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAF2O60831 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PRAF2O60831 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRAF2O60831 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAF2O60831 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAF2O60831 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAF2O60831 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRAF2O60831 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAF2O60831 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAF2O60831 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PRAF2O60831 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAF2O60831 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAF2O60831 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRAF2O60831 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PRAF2O60831 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms