Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMDSO60547 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMDSO60547 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMDSO60547 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMDSO60547 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GMDSO60547 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GMDSO60547 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GMDSO60547 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GMDSO60547 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GMDSO60547 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GMDSO60547 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GMDSO60547 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GMDSO60547 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GMDSO60547 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GMDSO60547 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GMDSO60547 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GMDSO60547 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GMDSO60547 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GMDSO60547 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GMDSO60547 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GMDSO60547 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GMDSO60547 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GMDSO60547 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GMDSO60547 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GMDSO60547 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GMDSO60547 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GMDSO60547 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GMDSO60547 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GMDSO60547 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GMDSO60547 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GMDSO60547 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GMDSO60547 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GMDSO60547 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GMDSO60547 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GMDSO60547 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GMDSO60547 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GMDSO60547 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GMDSO60547 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GMDSO60547 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GMDSO60547 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GMDSO60547 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GMDSO60547 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GMDSO60547 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GMDSO60547 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GMDSO60547 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GMDSO60547 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GMDSO60547 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GMDSO60547 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GMDSO60547 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GMDSO60547 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GMDSO60547 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GMDSO60547 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GMDSO60547 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GMDSO60547 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GMDSO60547 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GMDSO60547 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GMDSO60547 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GMDSO60547 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GMDSO60547 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GMDSO60547 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GMDSO60547 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GMDSO60547 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GMDSO60547 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GMDSO60547 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GMDSO60547 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GMDSO60547 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GMDSO60547 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GMDSO60547 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GMDSO60547 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GMDSO60547 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GMDSO60547 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GMDSO60547 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GMDSO60547 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GMDSO60547 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GMDSO60547 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GMDSO60547 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GMDSO60547 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GMDSO60547 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GMDSO60547 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GMDSO60547 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GMDSO60547 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GMDSO60547 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GMDSO60547 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GMDSO60547 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GMDSO60547 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GMDSO60547 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GMDSO60547 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GMDSO60547 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GMDSO60547 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GMDSO60547 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GMDSO60547 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GMDSO60547 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GMDSO60547 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GMDSO60547 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GMDSO60547 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GMDSO60547 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GMDSO60547 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GMDSO60547 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GMDSO60547 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GMDSO60547 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms