Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAK2O60296 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAK2O60296 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAK2O60296 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAK2O60296 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAK2O60296 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAK2O60296 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TRAK2O60296 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAK2O60296 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAK2O60296 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAK2O60296 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAK2O60296 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRAK2O60296 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAK2O60296 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRAK2O60296 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRAK2O60296 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRAK2O60296 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAK2O60296 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAK2O60296 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAK2O60296 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAK2O60296 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAK2O60296 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAK2O60296 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAK2O60296 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAK2O60296 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAK2O60296 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAK2O60296 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAK2O60296 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAK2O60296 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAK2O60296 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAK2O60296 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAK2O60296 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAK2O60296 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRAK2O60296 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRAK2O60296 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAK2O60296 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAK2O60296 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAK2O60296 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAK2O60296 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAK2O60296 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAK2O60296 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAK2O60296 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAK2O60296 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAK2O60296 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAK2O60296 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAK2O60296 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAK2O60296 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAK2O60296 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAK2O60296 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAK2O60296 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAK2O60296 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAK2O60296 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAK2O60296 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAK2O60296 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAK2O60296 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAK2O60296 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRAK2O60296 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAK2O60296 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAK2O60296 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAK2O60296 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAK2O60296 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAK2O60296 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAK2O60296 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAK2O60296 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAK2O60296 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAK2O60296 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAK2O60296 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAK2O60296 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAK2O60296 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAK2O60296 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAK2O60296 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAK2O60296 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAK2O60296 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAK2O60296 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAK2O60296 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAK2O60296 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAK2O60296 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAK2O60296 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAK2O60296 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAK2O60296 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAK2O60296 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK2O60296 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK2O60296 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK2O60296 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAK2O60296 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAK2O60296 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAK2O60296 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAK2O60296 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAK2O60296 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAK2O60296 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAK2O60296 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAK2O60296 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAK2O60296 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAK2O60296 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAK2O60296 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAK2O60296 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRAK2O60296 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAK2O60296 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAK2O60296 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAK2O60296 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms