Protein–RNA interactions for Protein: O43615

TIMM44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44O43615 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TIMM44O43615 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TIMM44O43615 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TIMM44O43615 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TIMM44O43615 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TIMM44O43615 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TIMM44O43615 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TIMM44O43615 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TIMM44O43615 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TIMM44O43615 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TIMM44O43615 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TIMM44O43615 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TIMM44O43615 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TIMM44O43615 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TIMM44O43615 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TIMM44O43615 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TIMM44O43615 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TIMM44O43615 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TIMM44O43615 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TIMM44O43615 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TIMM44O43615 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TIMM44O43615 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TIMM44O43615 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TIMM44O43615 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TIMM44O43615 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TIMM44O43615 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TIMM44O43615 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TIMM44O43615 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TIMM44O43615 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TIMM44O43615 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TIMM44O43615 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TIMM44O43615 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TIMM44O43615 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIMM44O43615 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIMM44O43615 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIMM44O43615 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIMM44O43615 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIMM44O43615 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TIMM44O43615 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TIMM44O43615 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TIMM44O43615 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TIMM44O43615 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TIMM44O43615 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TIMM44O43615 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TIMM44O43615 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIMM44O43615 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIMM44O43615 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIMM44O43615 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIMM44O43615 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TIMM44O43615 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms