Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GPAA1O43292 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GPAA1O43292 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GPAA1O43292 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GPAA1O43292 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GPAA1O43292 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
GPAA1O43292 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
GPAA1O43292 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GPAA1O43292 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GPAA1O43292 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GPAA1O43292 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GPAA1O43292 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GPAA1O43292 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GPAA1O43292 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GPAA1O43292 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GPAA1O43292 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GPAA1O43292 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GPAA1O43292 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
GPAA1O43292 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GPAA1O43292 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GPAA1O43292 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GPAA1O43292 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GPAA1O43292 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GPAA1O43292 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GPAA1O43292 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GPAA1O43292 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GPAA1O43292 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GPAA1O43292 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
GPAA1O43292 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GPAA1O43292 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GPAA1O43292 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
GPAA1O43292 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GPAA1O43292 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GPAA1O43292 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
GPAA1O43292 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GPAA1O43292 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GPAA1O43292 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GPAA1O43292 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GPAA1O43292 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GPAA1O43292 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GPAA1O43292 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GPAA1O43292 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GPAA1O43292 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GPAA1O43292 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GPAA1O43292 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GPAA1O43292 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GPAA1O43292 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GPAA1O43292 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GPAA1O43292 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GPAA1O43292 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
GPAA1O43292 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GPAA1O43292 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GPAA1O43292 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GPAA1O43292 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GPAA1O43292 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GPAA1O43292 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GPAA1O43292 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GPAA1O43292 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GPAA1O43292 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GPAA1O43292 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GPAA1O43292 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GPAA1O43292 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GPAA1O43292 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
GPAA1O43292 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GPAA1O43292 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GPAA1O43292 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
GPAA1O43292 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GPAA1O43292 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GPAA1O43292 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GPAA1O43292 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GPAA1O43292 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GPAA1O43292 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
GPAA1O43292 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GPAA1O43292 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GPAA1O43292 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GPAA1O43292 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GPAA1O43292 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
GPAA1O43292 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
GPAA1O43292 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GPAA1O43292 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GPAA1O43292 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GPAA1O43292 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GPAA1O43292 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GPAA1O43292 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GPAA1O43292 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GPAA1O43292 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GPAA1O43292 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
GPAA1O43292 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GPAA1O43292 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
GPAA1O43292 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
GPAA1O43292 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GPAA1O43292 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
GPAA1O43292 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
GPAA1O43292 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GPAA1O43292 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GPAA1O43292 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GPAA1O43292 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GPAA1O43292 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
GPAA1O43292 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
GPAA1O43292 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms