Protein–RNA interactions for Protein: O15321

TM9SF1, Transmembrane 9 superfamily member 1, humanhuman

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Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF1O15321 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM9SF1O15321 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM9SF1O15321 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TM9SF1O15321 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM9SF1O15321 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM9SF1O15321 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM9SF1O15321 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TM9SF1O15321 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM9SF1O15321 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TM9SF1O15321 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM9SF1O15321 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM9SF1O15321 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TM9SF1O15321 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM9SF1O15321 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TM9SF1O15321 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM9SF1O15321 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM9SF1O15321 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TM9SF1O15321 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM9SF1O15321 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM9SF1O15321 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM9SF1O15321 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TM9SF1O15321 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM9SF1O15321 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TM9SF1O15321 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM9SF1O15321 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TM9SF1O15321 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM9SF1O15321 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM9SF1O15321 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TM9SF1O15321 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM9SF1O15321 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM9SF1O15321 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TM9SF1O15321 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM9SF1O15321 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM9SF1O15321 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM9SF1O15321 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM9SF1O15321 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TM9SF1O15321 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM9SF1O15321 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM9SF1O15321 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TM9SF1O15321 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM9SF1O15321 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM9SF1O15321 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM9SF1O15321 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM9SF1O15321 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TM9SF1O15321 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM9SF1O15321 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TM9SF1O15321 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TM9SF1O15321 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TM9SF1O15321 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM9SF1O15321 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM9SF1O15321 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TM9SF1O15321 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TM9SF1O15321 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM9SF1O15321 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM9SF1O15321 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM9SF1O15321 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TM9SF1O15321 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM9SF1O15321 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TM9SF1O15321 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM9SF1O15321 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM9SF1O15321 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TM9SF1O15321 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TM9SF1O15321 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TM9SF1O15321 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM9SF1O15321 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM9SF1O15321 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM9SF1O15321 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM9SF1O15321 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TM9SF1O15321 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM9SF1O15321 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM9SF1O15321 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TM9SF1O15321 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TM9SF1O15321 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TM9SF1O15321 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TM9SF1O15321 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TM9SF1O15321 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TM9SF1O15321 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TM9SF1O15321 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TM9SF1O15321 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM9SF1O15321 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TM9SF1O15321 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM9SF1O15321 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM9SF1O15321 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TM9SF1O15321 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TM9SF1O15321 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TM9SF1O15321 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TM9SF1O15321 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM9SF1O15321 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM9SF1O15321 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TM9SF1O15321 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TM9SF1O15321 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TM9SF1O15321 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TM9SF1O15321 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM9SF1O15321 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM9SF1O15321 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM9SF1O15321 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TM9SF1O15321 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TM9SF1O15321 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TM9SF1O15321 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TM9SF1O15321 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
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