Protein–RNA interactions for Protein: O15234

CASC3, Protein CASC3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3O15234 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASC3O15234 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CASC3O15234 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CASC3O15234 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASC3O15234 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASC3O15234 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASC3O15234 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CASC3O15234 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CASC3O15234 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASC3O15234 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASC3O15234 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASC3O15234 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASC3O15234 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CASC3O15234 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASC3O15234 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASC3O15234 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASC3O15234 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASC3O15234 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASC3O15234 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CASC3O15234 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASC3O15234 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASC3O15234 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASC3O15234 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CASC3O15234 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CASC3O15234 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASC3O15234 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASC3O15234 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CASC3O15234 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASC3O15234 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASC3O15234 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASC3O15234 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASC3O15234 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASC3O15234 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASC3O15234 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CASC3O15234 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASC3O15234 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASC3O15234 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASC3O15234 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASC3O15234 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASC3O15234 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CASC3O15234 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC3O15234 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC3O15234 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC3O15234 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC3O15234 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC3O15234 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC3O15234 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CASC3O15234 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC3O15234 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC3O15234 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC3O15234 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC3O15234 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC3O15234 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC3O15234 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CASC3O15234 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC3O15234 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC3O15234 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CASC3O15234 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASC3O15234 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASC3O15234 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASC3O15234 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASC3O15234 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASC3O15234 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASC3O15234 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASC3O15234 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASC3O15234 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASC3O15234 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASC3O15234 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASC3O15234 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASC3O15234 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASC3O15234 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASC3O15234 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASC3O15234 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASC3O15234 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASC3O15234 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASC3O15234 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASC3O15234 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASC3O15234 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASC3O15234 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASC3O15234 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASC3O15234 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASC3O15234 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CASC3O15234 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASC3O15234 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASC3O15234 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASC3O15234 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CASC3O15234 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CASC3O15234 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASC3O15234 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASC3O15234 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASC3O15234 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASC3O15234 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CASC3O15234 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASC3O15234 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASC3O15234 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASC3O15234 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASC3O15234 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASC3O15234 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CASC3O15234 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASC3O15234 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms