Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ARPC1BO15143 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ARPC1BO15143 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARPC1BO15143 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ARPC1BO15143 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARPC1BO15143 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARPC1BO15143 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARPC1BO15143 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ARPC1BO15143 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ARPC1BO15143 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ARPC1BO15143 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARPC1BO15143 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARPC1BO15143 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ARPC1BO15143 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARPC1BO15143 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARPC1BO15143 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ARPC1BO15143 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARPC1BO15143 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARPC1BO15143 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARPC1BO15143 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARPC1BO15143 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARPC1BO15143 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARPC1BO15143 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARPC1BO15143 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARPC1BO15143 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARPC1BO15143 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARPC1BO15143 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARPC1BO15143 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARPC1BO15143 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARPC1BO15143 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARPC1BO15143 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARPC1BO15143 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARPC1BO15143 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC1BO15143 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC1BO15143 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC1BO15143 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARPC1BO15143 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC1BO15143 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC1BO15143 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC1BO15143 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC1BO15143 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC1BO15143 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC1BO15143 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARPC1BO15143 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARPC1BO15143 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ARPC1BO15143 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARPC1BO15143 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARPC1BO15143 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARPC1BO15143 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms