Protein–RNA interactions for Protein: O14983

ATP2A1, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A1O14983 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP2A1O14983 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP2A1O14983 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP2A1O14983 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP2A1O14983 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP2A1O14983 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATP2A1O14983 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATP2A1O14983 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ATP2A1O14983 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ATP2A1O14983 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP2A1O14983 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP2A1O14983 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP2A1O14983 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP2A1O14983 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATP2A1O14983 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATP2A1O14983 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP2A1O14983 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATP2A1O14983 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP2A1O14983 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2A1O14983 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2A1O14983 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2A1O14983 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2A1O14983 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP2A1O14983 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP2A1O14983 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATP2A1O14983 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP2A1O14983 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP2A1O14983 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP2A1O14983 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP2A1O14983 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP2A1O14983 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP2A1O14983 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP2A1O14983 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP2A1O14983 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP2A1O14983 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP2A1O14983 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP2A1O14983 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP2A1O14983 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP2A1O14983 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP2A1O14983 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP2A1O14983 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP2A1O14983 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP2A1O14983 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP2A1O14983 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP2A1O14983 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP2A1O14983 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP2A1O14983 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP2A1O14983 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP2A1O14983 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP2A1O14983 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP2A1O14983 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP2A1O14983 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP2A1O14983 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP2A1O14983 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATP2A1O14983 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP2A1O14983 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP2A1O14983 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP2A1O14983 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP2A1O14983 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP2A1O14983 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP2A1O14983 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP2A1O14983 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP2A1O14983 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP2A1O14983 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP2A1O14983 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP2A1O14983 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP2A1O14983 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP2A1O14983 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP2A1O14983 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP2A1O14983 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP2A1O14983 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2A1O14983 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2A1O14983 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2A1O14983 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2A1O14983 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2A1O14983 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP2A1O14983 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ATP2A1O14983 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2A1O14983 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2A1O14983 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2A1O14983 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2A1O14983 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2A1O14983 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP2A1O14983 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP2A1O14983 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP2A1O14983 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP2A1O14983 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP2A1O14983 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP2A1O14983 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP2A1O14983 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP2A1O14983 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ATP2A1O14983 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2A1O14983 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2A1O14983 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2A1O14983 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ATP2A1O14983 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP2A1O14983 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP2A1O14983 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP2A1O14983 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ATP2A1O14983 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms