Protein–RNA interactions for Protein: O14519

CDK2AP1, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK2AP1O14519 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK2AP1O14519 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDK2AP1O14519 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK2AP1O14519 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDK2AP1O14519 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDK2AP1O14519 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK2AP1O14519 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK2AP1O14519 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK2AP1O14519 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDK2AP1O14519 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK2AP1O14519 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK2AP1O14519 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDK2AP1O14519 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK2AP1O14519 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK2AP1O14519 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK2AP1O14519 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDK2AP1O14519 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK2AP1O14519 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK2AP1O14519 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK2AP1O14519 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK2AP1O14519 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK2AP1O14519 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDK2AP1O14519 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK2AP1O14519 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK2AP1O14519 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDK2AP1O14519 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK2AP1O14519 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDK2AP1O14519 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDK2AP1O14519 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDK2AP1O14519 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK2AP1O14519 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDK2AP1O14519 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK2AP1O14519 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK2AP1O14519 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDK2AP1O14519 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDK2AP1O14519 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK2AP1O14519 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK2AP1O14519 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK2AP1O14519 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK2AP1O14519 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK2AP1O14519 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDK2AP1O14519 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK2AP1O14519 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK2AP1O14519 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK2AP1O14519 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK2AP1O14519 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK2AP1O14519 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK2AP1O14519 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK2AP1O14519 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK2AP1O14519 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK2AP1O14519 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDK2AP1O14519 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK2AP1O14519 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK2AP1O14519 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDK2AP1O14519 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK2AP1O14519 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK2AP1O14519 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDK2AP1O14519 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK2AP1O14519 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK2AP1O14519 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK2AP1O14519 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK2AP1O14519 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK2AP1O14519 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK2AP1O14519 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDK2AP1O14519 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDK2AP1O14519 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms