Protein–RNA interactions for Protein: O00206

TLR4, Toll-like receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR4O00206 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLR4O00206 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR4O00206 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TLR4O00206 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR4O00206 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR4O00206 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR4O00206 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR4O00206 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLR4O00206 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR4O00206 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR4O00206 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR4O00206 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLR4O00206 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR4O00206 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR4O00206 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR4O00206 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR4O00206 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLR4O00206 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLR4O00206 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLR4O00206 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLR4O00206 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TLR4O00206 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR4O00206 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TLR4O00206 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR4O00206 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR4O00206 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TLR4O00206 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TLR4O00206 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR4O00206 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR4O00206 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR4O00206 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR4O00206 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR4O00206 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR4O00206 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TLR4O00206 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR4O00206 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR4O00206 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR4O00206 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR4O00206 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR4O00206 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR4O00206 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLR4O00206 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLR4O00206 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLR4O00206 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLR4O00206 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TLR4O00206 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLR4O00206 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLR4O00206 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TLR4O00206 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TLR4O00206 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TLR4O00206 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TLR4O00206 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TLR4O00206 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLR4O00206 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLR4O00206 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLR4O00206 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLR4O00206 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLR4O00206 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLR4O00206 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR4O00206 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR4O00206 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR4O00206 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLR4O00206 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLR4O00206 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLR4O00206 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLR4O00206 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLR4O00206 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLR4O00206 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLR4O00206 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLR4O00206 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR4O00206 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR4O00206 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR4O00206 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR4O00206 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR4O00206 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR4O00206 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR4O00206 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TLR4O00206 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR4O00206 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR4O00206 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR4O00206 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR4O00206 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR4O00206 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR4O00206 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLR4O00206 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TLR4O00206 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TLR4O00206 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TLR4O00206 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR4O00206 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR4O00206 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR4O00206 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR4O00206 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TLR4O00206 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR4O00206 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR4O00206 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLR4O00206 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLR4O00206 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLR4O00206 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TLR4O00206 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TLR4O00206 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms