Protein–RNA interactions for Protein: B2RXF0

TMEM229A, Transmembrane protein 229A, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229AB2RXF0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM229AB2RXF0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM229AB2RXF0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM229AB2RXF0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM229AB2RXF0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM229AB2RXF0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM229AB2RXF0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM229AB2RXF0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM229AB2RXF0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM229AB2RXF0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM229AB2RXF0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM229AB2RXF0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM229AB2RXF0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM229AB2RXF0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM229AB2RXF0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms