Protein–RNA interactions for Protein: B2RUY7

VWC2L, von Willebrand factor C domain-containing protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2LB2RUY7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWC2LB2RUY7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWC2LB2RUY7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWC2LB2RUY7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VWC2LB2RUY7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWC2LB2RUY7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWC2LB2RUY7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VWC2LB2RUY7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWC2LB2RUY7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWC2LB2RUY7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VWC2LB2RUY7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWC2LB2RUY7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWC2LB2RUY7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VWC2LB2RUY7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VWC2LB2RUY7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VWC2LB2RUY7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VWC2LB2RUY7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VWC2LB2RUY7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VWC2LB2RUY7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VWC2LB2RUY7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VWC2LB2RUY7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VWC2LB2RUY7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VWC2LB2RUY7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VWC2LB2RUY7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VWC2LB2RUY7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VWC2LB2RUY7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VWC2LB2RUY7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VWC2LB2RUY7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VWC2LB2RUY7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VWC2LB2RUY7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VWC2LB2RUY7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VWC2LB2RUY7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VWC2LB2RUY7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VWC2LB2RUY7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VWC2LB2RUY7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VWC2LB2RUY7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VWC2LB2RUY7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VWC2LB2RUY7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VWC2LB2RUY7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms