Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMIM23A6NLE4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SMIM23A6NLE4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMIM23A6NLE4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMIM23A6NLE4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM23A6NLE4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMIM23A6NLE4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMIM23A6NLE4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMIM23A6NLE4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMIM23A6NLE4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMIM23A6NLE4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMIM23A6NLE4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMIM23A6NLE4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMIM23A6NLE4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM23A6NLE4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM23A6NLE4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM23A6NLE4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM23A6NLE4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM23A6NLE4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM23A6NLE4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMIM23A6NLE4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMIM23A6NLE4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMIM23A6NLE4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMIM23A6NLE4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMIM23A6NLE4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMIM23A6NLE4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SMIM23A6NLE4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SMIM23A6NLE4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMIM23A6NLE4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMIM23A6NLE4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMIM23A6NLE4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMIM23A6NLE4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMIM23A6NLE4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMIM23A6NLE4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMIM23A6NLE4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMIM23A6NLE4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM23A6NLE4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM23A6NLE4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM23A6NLE4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM23A6NLE4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM23A6NLE4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM23A6NLE4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMIM23A6NLE4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMIM23A6NLE4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMIM23A6NLE4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMIM23A6NLE4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMIM23A6NLE4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMIM23A6NLE4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMIM23A6NLE4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMIM23A6NLE4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM23A6NLE4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM23A6NLE4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM23A6NLE4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM23A6NLE4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMIM23A6NLE4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMIM23A6NLE4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMIM23A6NLE4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM23A6NLE4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM23A6NLE4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM23A6NLE4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM23A6NLE4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM23A6NLE4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM23A6NLE4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM23A6NLE4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM23A6NLE4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM23A6NLE4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM23A6NLE4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM23A6NLE4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM23A6NLE4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMIM23A6NLE4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMIM23A6NLE4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms