Protein–RNA interactions for Protein: A6NHY6

C9orf118, Putative uncharacterized protein C9orf118, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf118A6NHY6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf118A6NHY6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf118A6NHY6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf118A6NHY6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf118A6NHY6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf118A6NHY6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf118A6NHY6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
C9orf118A6NHY6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
C9orf118A6NHY6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
C9orf118A6NHY6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C9orf118A6NHY6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
C9orf118A6NHY6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf118A6NHY6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms