Protein–RNA interactions for Protein: A4IF30

SLC35F4, Solute carrier family 35 member F4, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F4A4IF30 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC35F4A4IF30 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC35F4A4IF30 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC35F4A4IF30 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC35F4A4IF30 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC35F4A4IF30 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC35F4A4IF30 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC35F4A4IF30 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC35F4A4IF30 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC35F4A4IF30 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC35F4A4IF30 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC35F4A4IF30 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC35F4A4IF30 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35F4A4IF30 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35F4A4IF30 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC35F4A4IF30 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC35F4A4IF30 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC35F4A4IF30 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35F4A4IF30 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35F4A4IF30 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35F4A4IF30 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC35F4A4IF30 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35F4A4IF30 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35F4A4IF30 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35F4A4IF30 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35F4A4IF30 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35F4A4IF30 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35F4A4IF30 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35F4A4IF30 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC35F4A4IF30 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35F4A4IF30 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35F4A4IF30 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC35F4A4IF30 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35F4A4IF30 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35F4A4IF30 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35F4A4IF30 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35F4A4IF30 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35F4A4IF30 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC35F4A4IF30 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC35F4A4IF30 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC35F4A4IF30 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC35F4A4IF30 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC35F4A4IF30 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC35F4A4IF30 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC35F4A4IF30 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC35F4A4IF30 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC35F4A4IF30 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC35F4A4IF30 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC35F4A4IF30 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC35F4A4IF30 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC35F4A4IF30 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC35F4A4IF30 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC35F4A4IF30 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC35F4A4IF30 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC35F4A4IF30 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC35F4A4IF30 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC35F4A4IF30 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC35F4A4IF30 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC35F4A4IF30 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC35F4A4IF30 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms