Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBA6A0AVT1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBA6A0AVT1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBA6A0AVT1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBA6A0AVT1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBA6A0AVT1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBA6A0AVT1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBA6A0AVT1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBA6A0AVT1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBA6A0AVT1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBA6A0AVT1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBA6A0AVT1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBA6A0AVT1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBA6A0AVT1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBA6A0AVT1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBA6A0AVT1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBA6A0AVT1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBA6A0AVT1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBA6A0AVT1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBA6A0AVT1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBA6A0AVT1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBA6A0AVT1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBA6A0AVT1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBA6A0AVT1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBA6A0AVT1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBA6A0AVT1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBA6A0AVT1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBA6A0AVT1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBA6A0AVT1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBA6A0AVT1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBA6A0AVT1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBA6A0AVT1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBA6A0AVT1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBA6A0AVT1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBA6A0AVT1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBA6A0AVT1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBA6A0AVT1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBA6A0AVT1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBA6A0AVT1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBA6A0AVT1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBA6A0AVT1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBA6A0AVT1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBA6A0AVT1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms