Protein–RNA interactions for Protein: A0AVI4

TMEM129, E3 ubiquitin-protein ligase TM129, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM129A0AVI4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM129A0AVI4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM129A0AVI4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM129A0AVI4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM129A0AVI4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms