Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RR11

CENPVL1, Centromere protein V-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPVL1A0A0U1RR11 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPVL1A0A0U1RR11 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPVL1A0A0U1RR11 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPVL1A0A0U1RR11 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPVL1A0A0U1RR11 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPVL1A0A0U1RR11 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPVL1A0A0U1RR11 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPVL1A0A0U1RR11 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPVL1A0A0U1RR11 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPVL1A0A0U1RR11 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPVL1A0A0U1RR11 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPVL1A0A0U1RR11 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPVL1A0A0U1RR11 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPVL1A0A0U1RR11 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPVL1A0A0U1RR11 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPVL1A0A0U1RR11 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPVL1A0A0U1RR11 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPVL1A0A0U1RR11 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPVL1A0A0U1RR11 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPVL1A0A0U1RR11 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPVL1A0A0U1RR11 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPVL1A0A0U1RR11 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPVL1A0A0U1RR11 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPVL1A0A0U1RR11 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPVL1A0A0U1RR11 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPVL1A0A0U1RR11 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPVL1A0A0U1RR11 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPVL1A0A0U1RR11 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPVL1A0A0U1RR11 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPVL1A0A0U1RR11 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPVL1A0A0U1RR11 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPVL1A0A0U1RR11 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPVL1A0A0U1RR11 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPVL1A0A0U1RR11 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPVL1A0A0U1RR11 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPVL1A0A0U1RR11 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPVL1A0A0U1RR11 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPVL1A0A0U1RR11 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPVL1A0A0U1RR11 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPVL1A0A0U1RR11 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPVL1A0A0U1RR11 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPVL1A0A0U1RR11 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPVL1A0A0U1RR11 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPVL1A0A0U1RR11 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPVL1A0A0U1RR11 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPVL1A0A0U1RR11 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPVL1A0A0U1RR11 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPVL1A0A0U1RR11 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPVL1A0A0U1RR11 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPVL1A0A0U1RR11 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPVL1A0A0U1RR11 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPVL1A0A0U1RR11 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPVL1A0A0U1RR11 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPVL1A0A0U1RR11 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPVL1A0A0U1RR11 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CENPVL1A0A0U1RR11 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPVL1A0A0U1RR11 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPVL1A0A0U1RR11 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPVL1A0A0U1RR11 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPVL1A0A0U1RR11 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPVL1A0A0U1RR11 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPVL1A0A0U1RR11 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPVL1A0A0U1RR11 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPVL1A0A0U1RR11 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPVL1A0A0U1RR11 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPVL1A0A0U1RR11 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPVL1A0A0U1RR11 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPVL1A0A0U1RR11 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPVL1A0A0U1RR11 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPVL1A0A0U1RR11 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPVL1A0A0U1RR11 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPVL1A0A0U1RR11 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CENPVL1A0A0U1RR11 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms