Protein–RNA interactions for Protein: A0A096LP49

CCDC187, Coiled-coil domain-containing protein 187, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC187A0A096LP49 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC187A0A096LP49 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC187A0A096LP49 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC187A0A096LP49 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC187A0A096LP49 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC187A0A096LP49 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC187A0A096LP49 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC187A0A096LP49 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC187A0A096LP49 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC187A0A096LP49 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC187A0A096LP49 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC187A0A096LP49 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC187A0A096LP49 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC187A0A096LP49 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC187A0A096LP49 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC187A0A096LP49 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC187A0A096LP49 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC187A0A096LP49 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC187A0A096LP49 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC187A0A096LP49 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC187A0A096LP49 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC187A0A096LP49 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC187A0A096LP49 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC187A0A096LP49 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC187A0A096LP49 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC187A0A096LP49 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC187A0A096LP49 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC187A0A096LP49 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC187A0A096LP49 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC187A0A096LP49 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC187A0A096LP49 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC187A0A096LP49 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC187A0A096LP49 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC187A0A096LP49 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC187A0A096LP49 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC187A0A096LP49 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC187A0A096LP49 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC187A0A096LP49 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC187A0A096LP49 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC187A0A096LP49 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC187A0A096LP49 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC187A0A096LP49 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC187A0A096LP49 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC187A0A096LP49 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC187A0A096LP49 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC187A0A096LP49 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC187A0A096LP49 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC187A0A096LP49 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC187A0A096LP49 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC187A0A096LP49 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC187A0A096LP49 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC187A0A096LP49 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC187A0A096LP49 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC187A0A096LP49 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC187A0A096LP49 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC187A0A096LP49 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC187A0A096LP49 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC187A0A096LP49 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC187A0A096LP49 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC187A0A096LP49 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC187A0A096LP49 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC187A0A096LP49 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC187A0A096LP49 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC187A0A096LP49 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC187A0A096LP49 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC187A0A096LP49 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC187A0A096LP49 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC187A0A096LP49 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC187A0A096LP49 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC187A0A096LP49 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms