Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 COL6A5-201ENST00000265379 9214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ADA2-203ENST00000399837 4505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNJ2-204ENST00000367122 3029 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 XDH-201ENST00000379416 5688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF317-202ENST00000360385 3955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MTCL1-207ENST00000518815 3963 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR24-202ENST00000293883 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CLPB-201ENST00000294053 3240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 C12orf66-202ENST00000398055 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AHNAK2-204ENST00000557457 3436 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009108.4-201ENST00000623284 2451 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 WIPF1-204ENST00000392547 4587 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF2-202ENST00000367510 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC024257.3-201ENST00000595310 3645 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCC5-202ENST00000334444 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CAMK2G-207ENST00000423381 3824 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 FNBP1L-202ENST00000271234 4212 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC245505.2-201ENST00000553572 3055 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AL590999.1-202ENST00000607215 3053 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TXLNG-201ENST00000380122 4401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEC-206ENST00000357649 14689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ERG-208ENST00000417133 5023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TUBGCP2-201ENST00000252936 3885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO19-213ENST00000614623 4054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCA8-203ENST00000430352 5823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NBR1-202ENST00000542611 2703 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ITM2B-202ENST00000378565 10137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NCEH1-204ENST00000475381 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MET-202ENST00000397752 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PAK1-202ENST00000356341 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KBTBD12-201ENST00000343941 4121 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AKAP2-202ENST00000374525 6866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TNIP1-201ENST00000315050 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 BRD8-203ENST00000402931 2982 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 C22orf46-201ENST00000402966 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 STAMBP-203ENST00000394073 6386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 DSP-201ENST00000379802 9796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PHF3-201ENST00000262043 8233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK8-205ENST00000374182 5638 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF469-202ENST00000565624 13279 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MUC4-204ENST00000349607 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 HK1-202ENST00000359426 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 CICP26-201ENST00000425003 2448 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 COL4A5-201ENST00000328300 6483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 COL4A5-202ENST00000361603 6469 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ITGAL-202ENST00000358164 4673 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RAD17-205ENST00000354868 3060 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ABR-201ENST00000291107 2673 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF619-202ENST00000429348 4104 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC39C-203ENST00000540918 4117 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NLN-201ENST00000380985 8661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TPP2-202ENST00000376065 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 EPB41L2-224ENST00000530481 3914 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MUC3A-201ENST00000379458 11226 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NAGA-203ENST00000403363 1856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 METTL14-201ENST00000388822 6669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AMPD3-204ENST00000444303 3994 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NAIP-201ENST00000194097 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MYH2-202ENST00000397183 6078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RASGRP1-213ENST00000561180 2707 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 GP1BA-201ENST00000329125 2501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ARID1A-204ENST00000430799 6521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 ISX-201ENST00000308700 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF2A-201ENST00000381103 3360 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 NUDCD1-201ENST00000239690 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 PTCH2-201ENST00000372192 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 DCLK1-201ENST00000255448 5703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AP002761.1-201ENST00000400985 262 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AL512430.3-201ENST00000405355 441 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 AL590617.1-201ENST00000405630 748 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01015-204ENST00000445296 399 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL420P-201ENST00000463843 298 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL34P29-201ENST00000491411 325 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM92-202ENST00000507382 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms