Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNX18P27-201ENST00000523611 779 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC120498.4-201ENST00000561649 320 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005722.3-201ENST00000580884 446 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDLIM1P3-201ENST00000582370 599 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 EIF5AP3-201ENST00000589460 462 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNQ1OT1_2.1-201ENST00000619507 196 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNFAIP3-210ENST00000620204 3817 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC9A6-209ENST00000636347 4867 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 HTR2A-201ENST00000378688 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYT1L-202ENST00000399161 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 LUC7L3-208ENST00000505658 7040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLITRK3-202ENST00000475390 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPTAN1-203ENST00000372739 7868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARID2-201ENST00000334344 8642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLEKHA3-201ENST00000234453 13880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 METTL15-204ENST00000407364 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD46-202ENST00000322918 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF185-201ENST00000318504 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC079061.1-201ENST00000499579 3075 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02009-201ENST00000635852 2951 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 MOV10L1-209ENST00000540615 3941 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CTDSPL2-201ENST00000260327 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADGRG1-202ENST00000456916 3860 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 MATR3-201ENST00000394805 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 IFT122-202ENST00000347300 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 EFHB-201ENST00000295824 2823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 PPP1R3B-201ENST00000310455 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC7A6-201ENST00000219343 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCR9-201ENST00000355983 2653 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCARB2-211ENST00000638603 4284 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 JAKMIP2-206ENST00000616793 9272 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARNT2-207ENST00000533983 6690 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF175-201ENST00000262259 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANKRD13C-202ENST00000370944 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SAR1A-202ENST00000373238 3227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPATA13-201ENST00000343003 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAK-201ENST00000313243 3984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 EIF4G2-201ENST00000339995 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 MRPL22-206ENST00000522038 3162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 BDNF-216ENST00000532997 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC003958.2-202ENST00000432258 3890 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 MOV10L1-210ENST00000545383 3889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYRIP-210ENST00000539167 4635 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 DDHD1-210ENST00000612692 12339 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 DIDO1-206ENST00000395340 7551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 PARP1P1-201ENST00000413631 3026 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CKAP2L-201ENST00000302450 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANO2-201ENST00000327087 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF702P-201ENST00000270443 2990 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CSNK1G1-201ENST00000303052 8179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 UVSSA-201ENST00000324803 4441 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CSNK2A1-202ENST00000349736 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBM18-201ENST00000417201 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBQLN2-201ENST00000338222 4230 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 LPIN1-207ENST00000425416 5582 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 APH1B-201ENST00000261879 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 IFT122-201ENST00000296266 4151 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM129A-201ENST00000367511 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTF2-201ENST00000370298 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 HIPK1-208ENST00000426820 4112 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 TXLNB-201ENST00000358430 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYPN-205ENST00000613327 6116 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 NCOA1-204ENST00000405141 7405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC083902.2-201ENST00000511828 10086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 REV3L-202ENST00000368802 10701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCND1-202ENST00000376477 3306 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 BARD1-213ENST00000619009 3967 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SYNJ1-201ENST00000357345 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 SYNJ1-203ENST00000382499 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 IL17RD-202ENST00000320057 4474 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 CACNB2-209ENST00000396576 4464 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.206-201ENST00000364136 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.5 ms