Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ6

KRTAP4-11, Keratin-associated protein 4-11, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC087385.2-201ENST00000477729 498 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 IGKV1-27-201ENST00000498435 382 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AP004833.3-201ENST00000531893 322 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 BCAT1-204ENST00000538118 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RN7SL301P-202ENST00000618767 298 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SRSF6-201ENST00000244020 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CDH23-203ENST00000398788 4329 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SIM1-201ENST00000262901 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 DLG1-208ENST00000419354 3994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 EIF3F-208ENST00000533626 7540 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL353625.1-201ENST00000569097 3131 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MYH10-203ENST00000379980 7694 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 DDX53-201ENST00000327968 3629 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SLC35A4-202ENST00000514199 3617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 NRP1-212ENST00000432372 4137 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 IFT122-205ENST00000431818 4414 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 LINC02554-201ENST00000426467 5052 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 NAV2-213ENST00000533917 5084 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 C17orf75-201ENST00000225805 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 DDX10-203ENST00000526794 6707 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SUN1-219ENST00000452783 3717 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 COMMD2-203ENST00000473414 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AMOTL1-203ENST00000433060 8970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ADGRG1-216ENST00000562631 4042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 LINC00964-202ENST00000510897 3534 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 TTLL5-221ENST00000557636 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MARF1-211ENST00000551742 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 PTPRVP-201ENST00000482597 3999 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 FGD3-201ENST00000337352 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNFX1-204ENST00000396105 7371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 C2orf49-201ENST00000258457 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 HIST1H2BN-203ENST00000606613 4137 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 NCAM1-213ENST00000531044 2826 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 MAPK10-244ENST00000639972 2818 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 FMN1-207ENST00000559047 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 NUP210L-203ENST00000368559 5889 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AC139495.3-201ENST00000515156 4437 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 FMN1-203ENST00000558197 4060 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ADGRF5-202ENST00000283296 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 PARM1-201ENST00000307428 5011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ADGRE2-201ENST00000315576 6767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 FCN1-202ENST00000616356 4369 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 HSP90AB1-204ENST00000620073 2644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AKAP12-202ENST00000354675 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 GMEB1-203ENST00000373816 6410 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 CACNA1D-203ENST00000422281 6414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 ESRP1-202ENST00000423620 3746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 POGK-202ENST00000367876 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 TRIM16L-201ENST00000395671 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 STAG3-202ENST00000394018 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.05
KRTAP4-11Q9BYQ6 SNX13-203ENST00000428135 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SERBP1-203ENST00000370994 6676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 PLEKHG4B-201ENST00000283426 11515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 PRRG1-208ENST00000542554 4600 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 TAF8-210ENST00000494547 2402 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MXRA5-201ENST00000217939 9793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 CTCFL-222ENST00000609232 3668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SASH1-204ENST00000622663 5075 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 EXTL2-202ENST00000370114 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 ITPRIPL1-201ENST00000361124 4295 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 EPB41L2-221ENST00000529208 3023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RNF185-203ENST00000426256 3315 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 DEPDC5-205ENST00000400248 5307 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 NHS-204ENST00000615422 8860 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RP1-206ENST00000636932 3649 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 RUNX1T1-250ENST00000614812 7483 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 PCDHA10-203ENST00000562220 12358 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 TBPL1-201ENST00000237264 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 HNRNPU-219ENST00000639628 4546 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 MEGF10-203ENST00000503335 7571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 AL117258.1-201ENST00000637218 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 DPY19L4-201ENST00000414645 6197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 NKRF-201ENST00000304449 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP4-11Q9BYQ6 SCMH1-201ENST00000326197 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.7 ms