Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRPRBQ9Y5M8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRPRBQ9Y5M8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRPRBQ9Y5M8 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRPRBQ9Y5M8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRPRBQ9Y5M8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRPRBQ9Y5M8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SRPRBQ9Y5M8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRPRBQ9Y5M8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms