Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAPPC4Q9Y296 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms