Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSFQ9UBX1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSFQ9UBX1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSFQ9UBX1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSFQ9UBX1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSFQ9UBX1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSFQ9UBX1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSFQ9UBX1 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSFQ9UBX1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSFQ9UBX1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSFQ9UBX1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSFQ9UBX1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSFQ9UBX1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSFQ9UBX1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSFQ9UBX1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSFQ9UBX1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSFQ9UBX1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSFQ9UBX1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSFQ9UBX1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSFQ9UBX1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSFQ9UBX1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSFQ9UBX1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSFQ9UBX1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSFQ9UBX1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms