Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ42

PSENEN, Gamma-secretase subunit PEN-2, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSENENQ9NZ42 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSENENQ9NZ42 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSENENQ9NZ42 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSENENQ9NZ42 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PSENENQ9NZ42 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms