Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 Metazoa_SRP.91-201ENST00000622745 281 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 MAPK10-223ENST00000511167 1265 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXD4L1Q9NU39 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXD4L1Q9NU39 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms